该馆位于柏林自由大学校园内，是一座巨大的白色建筑，四四方方的，外表没有一点装饰。
柏林东亚艺术博物馆的前身是柏林皇家博物馆，属于当时的东普鲁士王国博物院。1918年，改成国立博物馆。一直到第二次世界大战爆发之前，该馆通过各种渠道使馆藏得到了极大丰富，现在是德国17个国立博物馆之一，在世界上享有一定的声望。
第二次世界大战使柏林变成一座废墟，柏林皇家博物馆也遭到彻底毁坏，超过90％的藏品被苏联军队作为战利品拿走，存放在俄国莫斯科和圣彼得堡的博物馆。后来经过反复交涉，俄国只归还了其中的300件文物，更多的还未能回到德国。战后经过重建，柏林东亚艺术博物馆由小到大，终于形成了现在的规模。1992年，该馆将远东艺术收藏品集中到一起作常年展览。其所藏1.2万件亚洲文物来自中国、日本、韩国和越南，其中中国文物有2000件左右，规模虽不算大，但也有自己的特点。